Université Lyon 1
Université de Lyon
Arqus
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  • Domaine : Masters du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
  • Diplôme : Master
  • Mention : Biochimie - biologie moléculaire
  • Parcours : Biochimie structurale et fonctionnelle
  • Unité d'enseignement : Macromolécules Extracellulaires
Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BCH1019M
UE Optionnelle pour ce parcours
UE valable pour le semestre 2 de ce parcours
    Responsabilité de l'UE :
RICARD-BLUM SYLVIE
 sylvie.ricard-blumuniv-lyon1.fr
04.72.44.82.32
    Contact scolarité :
BENKADOUR CHRYSTELL
 chrystell.benkadouruniv-lyon1.fr
04.72.43.29.59
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
34.5 h
Travaux Dirigés (TD)
15 h
Travaux Pratiques (TP)
7.5 h
Total du volume horaire
57 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Conditions d'accès à l'UE :
Licence de Biochimie ou de Biologie
    Programme - Contenu de l'UE :

Objectifs : Compléter la formation des étudiants en biochimie structurale et fonctionnelle par l’introduction des propriétés spécifiques de macromolécules biologiques (protéines et polysaccharides) et leurs applications dans le domaine biomédical et notamment de la médecine régénérative. Les macromolécules extracellulaires possèdent la capacité de s'organiser en un réseau tridimensionnel pour former la matrice extracellulaire qui constitue la charpente des tissus. Ce sont les propriétés structurales des macromolécules extracellulaires et les interactions qu'elles établissent entre elles qui assurent la cohésion ainsi que les propriétés physiques et biologiques de la matrice extracellulaire. Ces macromolécules constituent également un réservoir de fragments doués d'activités biologiques qui seront étudiés. Cette UE soulignera l'importance des relations structure-fonction des macromolécules extracellulaires, leur implication dans les processus physiopathologiques et leur utilisation pour les biomatériaux et l’ingénierie tissulaire.

Les principales familles de protéines et de protéoglycanes extracellulaires

- La superfamille des collagènes : structure en triple hélice, biosynthèse et modifications post-traductionnelles spécifiques, assemblages supramoléculaires, fonctions structurales et biologiques, mutations des gènes codant pour les collagènes et les pathologies associées (ostéogenèse imparfaite, chondrodysplasies, syndrome d’Ehlers-Danlos, syndrome d’Alport

- Les glycosaminoglycanes : diversité structurale, interactions avec les autres constituants de la matrice extracellulaire, fonctions biologiques (développement, interactions hôte-pathogènes). Les mucopolysaccharidoses.

- Les protéoglycanes : les différentes familles de protéoglycanes, notamment les protéoglycanes membranaires (rôle de récepteurs ou co-récepteurs, processus de shedding) et les protéoglycanes extracellulaires. Rôles structuraux et biologiques (signalisation, inflammation) des protéoglycanes. Mutations des gènes codant pour la partie protéique des protéoglycanes et les pathologies associées

- La fibronectine et ses variants 

-  Les laminines (domaines coiled-coil) : les isoformes, leurs rôles 

- Les fibres élastiques, des assemblages biologiques complexes : composition, rôles, pathologies associées

-  Les protéines matricellulaires : SPARC, les thrombospondines, les ténascines, rôles dans le cancer

 

Le remodelage de la matrice extracellulaire

- Les métalloprotéinases matricielles (famille des metzincines) : les différentes classes de métalloprotéases et leur structure, leur activation ("cysteine switch"), leur rôle dans le remodelage tissulaire et l'invasion tumorale

- Les matricryptines : des fragments doués d’activités biologiques spécifiques (anti-tumorales, anti-angiogénique), définition, exemples, potentiel thérapeutique

 

Interactions de la matrice extracellulaire avec les cellules

- Des récepteurs des macromolécules extracellulaires : les intégrines et les récepteurs à domaine discoïdine

 

Utilisation des macromolécules extracellulaires pour les biomatériaux et l’ingénierie tissulaire

Substituts cutanés, visco-supplémentation, impression 3D

 

Travaux Dirigés : réalisation d’une affiche et présentation orale de cette affiche

Travaux Pratiques caractérisation de protéines extracellulaires

    Compétences acquises :
Méthodologiques :
Relations structure-fonction de macromolécules biologiques

Techniques :
Analyse d'articles scientifiques
Présentation de résultats scientifiques sous forme d'une affiche et d'une présentation orale
    Modalités de contrôle des connaissances et Compétences 2020-2021:
TypeLibelléNatureCoef. 
CTContrôle TerminalCT : Macromol. extracell. biomat.Ecrit session 1 / Ecrit session 24.2
CCContrôle ContinuCC : Macromol. extracell. biomat.Contrôle Continu1.8
Date de la dernière mise-à-jour : 06/05/2020
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