Université Lyon 1
Université de Lyon
Arqus
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  • Domaine : Masters du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
  • Diplôme : Master
  • Mention : Biologie
  • Parcours : M1 Biosciences
  • Unité d'enseignement : Génétique et génomique des populations
Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BIO1289M
UE Libre pour ce parcours
UE valable pour le semestre 1 de ce parcours
    Responsabilité de l'UE :
VARALDI JULIEN
 julien.varaldiuniv-lyon1.fr
04.72.44.81.01
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
18 h
Travaux Dirigés (TD)
14 h
Travaux Pratiques (TP)
16 h
Durée de projet en autonomie de l'étudiant (PRJ)
0 h
Durée du stage
0 h
Effectifs Cours magistraux (CM)
210 étudiants
Travaux dirigés (TD)
35 étudiants
Travaux pratiques (TP)
18 étudiants

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

Compétences acquises : méthodologie :

- Développer une conscience critique des savoirs dans un domaine et/ou à l’interface de plusieurs domaines

BLOC Communication spécialisée pour le transfert de connaissances :

- Identifier, sélectionner et   analyser avec esprit critique diverses ressources spécialisées pour   documenter un sujet et synthétiser ces données en vue de leur exploitation 

- Communiquer à des fins de formation ou de transfert de   connaissances, par oral et par écrit, en français et dans au moins une langue   étrangère  

Compétences acquises : technique :

- Se servir de façon autonome des outils numériques avancés pour   un ou plusieurs métiers ou secteurs de recherche du domaine     

    Programme de l'UE / Thématiques abordées :

L’UE présente les outils et concepts essentiels à l’étude des variations génétiques existant au sein et entre les populations (polymorphisme). Le développement récent des techniques de séquençages haut-débit donne aujourd’hui une puissance inégalée pour comprendre le fonctionnement des populations. C’est clairement pour l’exploitation de ce type de données « genome-wide » que l’UE est organisée. Notions abordées :

-  Le modèle de Hardy-Weinberg

-  Déséquilibre gamétique

-  mutation, migration, sélection, dérive, indices de différentiation, comparaison marqueurs neutres / selectionnés, taille efficace

- introduction à la théorie du coalescent

- inférence de l’histoire démographique à partir de données de polymorphisme (méthodes ABC)

- détection de sélection et d’hybridation dans les génomes à partir de données de polymorphisme.

- introduction à la notion de conflit génomique.

L’UE est résolument « pratique » à travers des TD et plusieurs TP sur machine, au cours desquels les étudiants partiront des données brutes de séquençage (provenant notamment du projet des « 1000 génomes » humains) pour analyser la structuration des populations, inférer l’histoire démographique des populations ou identifier des régions génomiques sous sélection. Des conférences de chercheurs/chercheuses seront également au programme afin de mobiliser les concepts et outils appris au cours de l’UE dans différents contextes de recherche.

    Modalités de contrôle des connaissances et Compétences 2021-2022 :
TypeLibelléSessionNatureCoef. 
CTCT : Génétique et génomique populationssession 1Ecrit-
CTCT : Génétique et génomique populationssession 2Ecrit-
CCCC : Génétique et génomique populationssession 1Contrôle Continu-
CCCC : Génétique et génomique populationssession 2Contrôle Continu-
Date de la dernière mise-à-jour : 31/03/2018
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