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Arqus
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  • Domaine : Masters du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
  • Diplôme : Master
  • Mention : Bio-informatique
  • Parcours : M2 Bio-informatique moléculaire: méthodes et analyses
  • Unité d'enseignement : Modélisation probabiliste en bio-informatique
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BIO1342M
UE Obligatoire pour ce parcours
UE valable pour le semestre 2 de ce parcours
    Responsabilité de l'UE :
GUEGUEN LAURENT
 laurent.gueguenuniv-lyon1.fr
04.72.44.62.98
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
10 h
Travaux Dirigés (TD)
0 h
Travaux Pratiques (TP)
20 h
Total du volume horaire
30 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Programme - Contenu de l'UE :
En bioinformatique, la manipulation et l’analyse de données nécessitent très souvent des méthodes à même de gérer la complexité et la variabilité des données, ainsi que le bruit présent dans ces données (dû aussi bien à la stochasticité des processus biologiques à l’origine de ces données, qu’aux techniques d’acquisition). Ces méthodes font essentiellement appel à la modélisation probabiliste. Il est nécessaire que les étudiants, à la fois pour comprendre les méthodes existantes que pour ensuite en concevoir de nouvelles, connaissent les ressorts d’une telle modélisation, à la fois conceptuels et techniques. Ainsi, nous étudierons les concepts fondamentaux de la modélisation probabiliste (vraisemblance, maximum de vraisemblance, démarche bayésienne, décodage a posteriori), ainsi que des modèles usuels (chaînes de Markov),  dans le contexte de leur utilisation en bioinformatique.
    Compétences acquises :
Méthodologiques :
Concepts et outils usuels de modélisation probabiliste, qui sont au coeur de nombreux outils
de bioinformatique


Techniques :
Programmation en R & python de modèles, tests statistiques et algorithmes d'analyse de données, avec une orientation probabiliste.
    Modalités de contrôle des connaissances et Compétences 2021-2022 :
TypeLibelléNatureCoef. 
CTContrôle TerminalCT : Modelisation proba. en bio-infoEcrit Session 1 / Oral Session 23
    Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
Date de la dernière mise-à-jour : 15/11/2021
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