Domaine : Masters du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
Diplôme : Master
Mention : Bio-informatique
Parcours : M2 Bio-informatique moléculaire: méthodes et analyses
Unité d'enseignement : Modélisation probabiliste en bio-informatique
Nombre de crédits de l'UE : 3 Code APOGEE : BIO1342M UE Obligatoire pour ce parcours UE valable pour le semestre 2 de ce parcours
Responsabilité de l'UE :
GUEGUEN LAURENT
laurent.gueguenuniv-lyon1.fr
04.72.44.62.98
Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
10 h
Travaux Dirigés (TD)
0 h
Travaux Pratiques (TP)
20 h
Total du volume horaire
30 h
* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.
Programme - Contenu de l'UE :
En bioinformatique, la manipulation et l’analyse de données nécessitent très souvent des méthodes à même de gérer la complexité et la variabilité des données, ainsi que le bruit présent dans ces données (dû aussi bien à la stochasticité des processus biologiques à l’origine de ces données, qu’aux techniques d’acquisition). Ces méthodes font essentiellement appel à la modélisation probabiliste. Il est nécessaire que les étudiants, à la fois pour comprendre les méthodes existantes que pour ensuite en concevoir de nouvelles, connaissent les ressorts d’une telle modélisation, à la fois conceptuels et techniques. Ainsi, nous étudierons les concepts fondamentaux de la modélisation probabiliste (vraisemblance, maximum de vraisemblance, démarche bayésienne, décodage a posteriori), ainsi que des modèles usuels (chaînes de Markov), dans le contexte de leur utilisation en bioinformatique.
Compétences acquises :
Méthodologiques :
Concepts et outils usuels de modélisation probabiliste, qui sont au coeur de nombreux outils
de bioinformatique
Techniques :
Programmation en R & python de modèles, tests statistiques et algorithmes d'analyse de données, avec une orientation probabiliste.
Modalités de contrôle des connaissances et Compétences 2021-2022 :
Type
Libellé
Nature
Coef.
CT
Contrôle Terminal
CT : Modelisation proba. en bio-info
Ecrit Session 1 / Oral Session 2
3
Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
SELECT * FROM parcours INNER JOIN ue_parcours ON PAR_ID_FK=PAR_ID INNER JOIN mention ON MEN_ID = PAR_MENTION_FK WHERE PAR_ACTIVATE = 0 AND UE_ID_FK='21720' ORDER BY UE_ID_FK ASC, PAR_ID_FK ASC