Outils stats et informatiques pour les analyses omiques : Fiche UE : Offre de formation

Domaine : Masters du domaine SCIENCES ET TECHNOLOGIES
Diplôme : Master
Mention : Cancer
Parcours : M2 Médecine de Précision en Cancérologie
Unité d'enseignement : Outils stats et informatiques pour les analyses omiques

Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : IPH2292M
UE Libre pour ce parcours
UE valable pour le semestre 1 de ce parcours

Responsabilité de l'UE :

BARDEL DANJEAN CLAIRE

claire.bardel-danjeanuniv-lyon1.fr

SAINTIGNY PIERRE

pierre.saintignyuniv-lyon1.fr

Type d'enseignement

Nb heures *

Cours Magistraux (CM)

8 h

Travaux Dirigés (TD)

8 h

Travaux Pratiques (TP)

14 h

Durée de projet en autonomie (PRJ)

0 h

Durée du stage

0 h

Effectif Cours magistraux (CM)

210 étudiants

Effectif Travaux dirigés (TD)

35 étudiants

Effectif Travaux pratiques (TP)

12 étudiants

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

* Savoir choisir la méthode statistique appropriée pour le traitement et la visualisation de données massives

* Savoir interpréter les résultats des analyses statistiques

* Savoir manipuler des fichiers avec R et avec les outils de base unix (bash, grep, ...)

Programme de l'UE / Thématiques abordées :

Cette UE à pour but de former les étudiants aux outils biostatistiques et bioinformatique
utiles pour analyser des données massives en cancérologie. Les différentes notions abordées
sont:
* introduction à l'utilisation de linux et à la manipulation de fichiers en ligne de commande
* introduction à R pour la manipulation et la visualisation des données ainsi que pour l'analyse statistique

* bases de statistiques pour l'analyse des données massives (techniques de réduction de la dimension, régressions logistique et linéaire, corrections pour les tests multiples, évaluation des biomarqueurs, méthodes de classification)

Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :

[mention : Cancer] M2 Médecine de Précision en Cancérologie