Université Lyon 1
Arqus
  • Domaine : Masters du domaine SCIENCES ET TECHNOLOGIES
  • Diplôme : Master
  • Mention : Biochimie - biologie moléculaire
  • Parcours : M2 Ingénierie biochimique et biotechnologies
  • Unité d'enseignement : Protein design
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BCH2039M
UE Libre pour ce parcours
UE valable pour le semestre 1 de ce parcours
    Responsabilité de l'UE :
AGUERO-PIZZOLO STEPHANIE
 stephanie.aguero-pizzolouniv-lyon1.fr
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
7.5 h
Travaux Dirigés (TD)
1.5 h
Travaux Pratiques (TP)
9 h
Durée de projet en autonomie (PRJ)
0 h
Durée du stage
0 h
Effectif Cours magistraux (CM)
210 étudiants
Effectif Travaux dirigés (TD)
35 étudiants
Effectif Travaux pratiques (TP)
6 étudiants

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Pré-requis :
    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

competences spécifiques :

Se former aux bases du Protein Design. 

Connaitre les principales approches de conception. 

Savoir définir un objectif de conception en réponse à une problématique concrète. 

Apprendre à mettre en œuvre une stratégie de conception rationnelle (de la phase in silico en passant par la production et la validation expérimentale des modèles proposés).

Compétences trasnversales :
Résoudre des problèmes pour développer de nouveaux savoirs et de nouvelles procédures et intégrer les savoirs de différents domaines
Conduire un projet
    Programme de l'UE / Thématiques abordées :

Thèmes abordés : Conception rationnelle de protéines, Evolution dirigée, Interactions protéines-protéines.


Techniques mises en œuvre : Conception computationnelle de protéine (CPD), mutagénèse dirigée, tests d’affinité et de liaison


L’UE se composera de :

  • 7,5h de cours portant sur l’histoire du Protein Design, les différentes stratégies existantes ainsi que les réalisations les plus marquantes de ce domaine. Le cours inclura également une partie portant sur les méthodes informatiques et expérimentales mobilisées.
  • 1,5h de TD au cours desquels les étudiants prépareront le TP (bibliographie sur le sujet, définition de l’objectif de conception et proposition de stratégie)
  • 9h de TP réparties en deux temps : 4h de CPD « Computational protein design » suivi de 5h de validation expérimentale des modèles générés.
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