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Arqus
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  • Domaine : Masters du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
  • Diplôme : Master
  • Mention : Biochimie - biologie moléculaire
  • Parcours : Biochimie structurale et fonctionnelle
  • Unité d'enseignement : Régulation, Réparation et Homéostasie cellulaires
Nombre de crédits de l'UE : 9
Code APOGEE : BCH1014M
UE Obligatoire pour ce parcours
UE valable pour le semestre 2 de ce parcours
    Responsabilité de l'UE :
KUCHARCZAK JEROME
 jerome.kucharczakuniv-lyon1.fr
04.26.23.59.43
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
25.5 h
Travaux Dirigés (TD)
19 h
Travaux Pratiques (TP)
38 h
Total du volume horaire
82.5 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Programme - Contenu de l'UE :
A côté des formes classiques d'enseignement (cours, travaux dirigés, travaux pratiques - voir le programme détaillé ci-dessous), les étudiants effectuent au cours du semestre des recherches bibliographiques en groupe, afin de produire eux-mêmes une partie de cours ou un poster, et de présenter le résultat de ce travail à l'oral devant toute la promotion.  Ce travail est accompagné par l'équipe enseignante au cours de 5 séances durant le semestre.
Les séances de travaux dirigés, s'appuyant sur des données scientifiques et des publications données en sujet d'examen les années précédentes, préparent les étudiants à cet exercice et illustrent le cours.
Le stage de travaux pratiques, qui tire notamment partie des connaissances acquises lors de l'UE "Ingénierie moléculaire" du semestre d'automne, est également défendu à l'oral afin de développer les capacités de synthèse et d'expression orale des étudiants.

Réparation de l’ADN
- Dommages à l'ADN (spontanés, naturels, ou induits).
- Mécanismes de réparation eucaryotes et maladies associées (réversion, photolyases, NER, BER, SSBR, DSBR, MMR, TCR, réparation mitochondriale).

Mort cellulaire
- Apoptose: principaux mécanismes et protéines impliquées; apoptose et développement chez les vertébrés.
- Nécrose versus apoptose, devenir des corps apoptotiques et des cellules nécrotiques.
- Nécroptose. Exemple des plaques d’athérosclérose pour illustrer la survenue et le rôle de l’apoptose, de la nécrose et de la nécroptose en situation pathologique.
- Autophagie: l’axe autophago-lysosomal, les différentes formes d’autophagie, maladies associées (cancer, maladies neuro-dégénératives, pistes thérapeutiques).
- Système ubiquitine-protéasome: mécanisme, pathologies associées, cibles thérapeutiques.

 Homéostasie cellulaire et cancer
- Oncogenèse, transporteurs ABC, résistance multidrogues.
- Récepteurs à dépendance.
- Homéostasie calcique (traffic du calcium intracellulaire, canaux calciques associés au réticulum endoplamique et à la mitochondrie).
- Bases moléculaires du vieillissement cellulaire: aspects génétiques et épigénétiques.
- Thérapeutiques ciblées des cancers.
- Intégration des mécanismes au travers d'exemples: protéines p53 et BRCA1. 

TRAVAUX PRATIQUES : Sous-clonage, mutagenèse dirigée par PCR, étude d'interactions protéiques par double hybride chez la levure, utilisation d'outils informatiques de biologie moléculaire et bioinformatique.

    Compétences acquises :
Méthodologiques :
  • Lecture et analyse de publications scientifiques.
  • Capacité à réaliser un résumé pertinent de publication scientifique.
  • A partir d'un thème imposé, capacité à rechercher, synthétiser et exposer des données scientifiques à l'oral et à l'écrit, en utilisant un vocabulaire précis.
  • Capacité à réaliser une syntèse bibliographique écrite.
  • Capacité à travailler en groupe.


Techniques :
Les travaux pratiques sont constitués d'un stage de 4 jours permettant la mise en oeuvre des techniques suivantes:
  • sous-clonage;
  • mutagenèse dirigée par PCR;
  • western-blot;
  • étude d'interactions protéiques par double-hybride chez la levure.
Ce stage permet également d'utiliser des outils informatiques: logiciels de biologie moléculaire et de manipulation de structure protéique, recherche dans les bases de données structurales.
    Modalités de contrôle des connaissances et Compétences 2020-2021:
TypeLibelléNatureCoef. 
CTContrôle TerminalCT : RRHCEcrit session 1 / Ecrit session 24.5
CCContrôle ContinuCC : RRHCContrôle Continu2.25
CTContrôle TerminalCT : RRHCOral / Soutenance2.25
    Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
Date de la dernière mise-à-jour : 14/11/2020
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