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  • Domaine : Licences du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
  • Diplôme : Licence
  • Mention : Sciences de la Vie
  • Parcours : Sciences de la biodiversité
  • Unité d'enseignement : Biostatistiques et bioinformatique
Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BIO2006L
UE Obligatoire pour ce parcours
UE valable pour le semestre 4 de ce parcours
    Responsabilité de l'UE :
VENNER MARIE-CLAUDE
 marie-claude.venneruniv-lyon1.fr
04.72.43.29.02
 marie-claude.venneruniv-lyon1.fr
MARY ARNAUD
 arnaud.maryuniv-lyon1.fr
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
18 h
Travaux Dirigés (TD)
22.5 h
Travaux Pratiques (TP)
15 h
Total du volume horaire
55.5 h
* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.
    Conditions d'accès à l'UE :
UE recommandée : Mathématiques pour les Sciences de la Vie , ou équivalent
    Programme - Contenu de l'UE :
Le cours de Biostatistiques vous présente les principaux outils méthodologiques nécessaires à l’analyse et à la compréhension de phénomènes biologiques simples. Un rappel des outils vus en L1 permettra une mise à niveau pour les étudiants intégrant directement en L2 : les tests d'hypothèses - le khi-deux. De nouvelles analyses seront présentées : analyse de variance à un et  deux facteurs - régression linéaire simple. L'objectif est toujours d'une part de développer une intuition de la théorie sous-jacente à ces techniques, grâce aux cours, et d'apprendre à les utiliser sur des données biologiques lors des TD. Les séances de TP sur machine permettent de manipuler de gros jeux de données et de s'initier au logiciel R, et de faire les liens entre les  cours, les TD et les TP.

Le cours de Bioinformatique vous présente à la fois d'un point de vue théorique et pratique les outils bioinformatiques les plus récents utilisés dans le cadre soit de la génomique, de la biologie ou de l'écologie :  recherche de signaux dans une séquence, analyse de la biodiversité. Les travaux pratiques permettront aux étudiants de se familiariser avec les logiciels existants et couramment utilisés en bio-informatique.
    Compétences acquises :
Méthodologiques :
Formalisation mathématique d’un problème biologique.

Techniques :
Acquisition des outils de statistique et de bioinformatique de base pour l’analyse de phénomènes biologiques.
    Modalités de contrôle des connaissances et Compétences 2019-2020 :
TypeLibelléNatureCoef. 
CTContrôle TerminalCT : BioStatistiques et BioInformatiqueEcrit session 1 / Ecrit session 24
CTContrôle TerminalCT : BioStatistiques et BioInformatiqueEcrit session 1 / Ecrit session 22
    Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
Date de la dernière mise-à-jour : 22/05/2018
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