Pré-requis : Connaissances générales sur la microbiologie. (cf. PACES : UE spécialité Pharmacie module bases fondamentales microbiologie : biomédicaments)
Cours Magistral divisé en trois parties :
- Introduction à la phylogénie (1h, C. Bardel) : Méthodes de reconstruction phylogénétique et présentation de l'arbre du vivant.
- Biodiversité bactérienne et fongique (2h, V. Rodriguez-Nava) : Place des bactéries et des champignons dans les écosystèmes; Implications pour l'homme ; Biodiversité et systématique.
- Organisation animale (8h, P. Lawton) : Organisation animale - évolution du monde animal, intérêts chez l'Homme.
Enseignements Dirigés (3h, V. Rodriguez-Nava et D. Blaha) :
Biodiversité bactérienne :
- Bases et principes du diagnostic bactériologique,
- Techniques d’identification chez certaines bactéries d’intérêt médical (E. coli, Staphylococcus, Pseudomonas, Bacillus, etc) et d’actinobactéries d’intérêt médical et/ou industriel (Nocardia, Streptomyces, Rhodococcus, Gordonia).
Biodiversité fongique : - Principales caractéristiques macroscopiques et microscopiques pour l’identification de micromycètes d’intérêt médical et/ou industriel.Travaux Pratiques (9h, D. Blaha, V. Rodriguez-Nava) :
- Identification de base des principaux genres bactériens y compris les actinobactéries.
- Identification macroscopique et microscopique des principaux genres fongiques présents dans différents environnements.- Techniques de base de manipulation pour l’identification microscopique des champignons.
