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  • Domaine : Attestations d'études universitaires en Sciences et Technologies
  • Diplôme : Attestation d'Etudes Universitaires (AEU)
  • Mention : AEU Sciences et technologies
  • Parcours : École Universitaire de Recherche H2O (AEU EUR H2O)
  • Unité d'enseignement : Phylogénomique et évolution moléculaire
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BIO2398M
UE Libre pour ce parcours
UE valable pour le semestre 1 de ce parcours
    Responsabilité de l'UE :
BROCHIER ARMANET CELINE
 celine.brochier-armanetuniv-lyon1.fr
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
6 h
Travaux Dirigés (TD)
0 h
Travaux Pratiques (TP)
15 h
Durée de projet en autonomie de l'étudiant (PRJ)
0 h
Durée du stage
0 h
Effectifs Cours magistraux (CM)
210 étudiants
Travaux dirigés (TD)
35 étudiants
Travaux pratiques (TP)
18 étudiants

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

À l'issue de ce module, l'étudiant aura acquis les compétences nécessaires dans le cadre de développement en Bioinformatique moléculaire.

 


    Programme de l'UE / Thématiques abordées :

1/ Évolution moléculaire
- Introduction : l'évolution moléculaire avant et après la révolution génomique
- Avancées actuelles en évolution moléculaire : quelques exemples approfondis
- Évolution de la taille des génomes et écologie des organismes
- Les éléments transposables et leur impact sur le génome
- Origine et évolution des chromosomes sexuels des animaux et des plantes
- Variation de la composition en base génomes

 

2/ Phylogénie
- Alignement : revue des différentes méthodes d'alignement de séquences
- Distance : Méthodes d'estimation des distances évolutives (modèle markovien, modèle spécifique)
- Phylogénie : Méthodes de reconstruction phylogénétique en insistant sur le maximum de vraisemblance,
les méthodes bayésiennes et l'évaluation de la fiabilité des arbres
- Discussion des biais dans les reconstructions en fonction des modèles évolutifs utilisés

 

3/ Mini-projets par groupes d'étudiants
Date de la dernière mise-à-jour : 27/05/2021
SELECT * FROM parcours INNER JOIN ue_parcours ON PAR_ID_FK=PAR_ID INNER JOIN mention ON MEN_ID = PAR_MENTION_FK WHERE PAR_ACTIVATE = 0 AND UE_ID_FK='16229' ORDER BY UE_ID_FK ASC, PAR_ID_FK ASC