L'objectid de cette UE ets de présenter les différents aspects de la biologie de synthèse, les outils informatiques et biologiques nécessaires respectivement à la conception et la construction de dispositifs biologiques synthétiques, les différentes étapes de leur construction puis leurs applications dans le domaine de la santé, de l'agro-alimentaire, de l'environnement et de l'énergie.
Thèmes abordés
- Définition et buts
- Biosûreté, biosécurité, double usage de la recherche, enjeux sociétaux
- Les biobriques : définition, construction, méthodes d’assemblage
- Les châssis : bactéries, levures
- Les outils : choix des éléments, surcharge de l’hôte), vitesse d’initiation de la traduction d’une séquence, force des promoteurs, riborégulateurs, TIGRs, scaffolds, microcompatimentation, réactions enzymatiques couplées et flux métaboliques,
- Exemples de systèmes synthétiques synthèse d’anti-paludéen,, microbes thérapeutiques
- Génômes artificiels, évolution chimique des génômes, la xénobiologie
- Les répressilateurs
- Aspects prédictifs à la biologie de synthèse : problématiques (allocation des ressources, équilibres homéostatiques…), modélisation métabolique (reconstruction du métabolisme à l’échelle du génome, principe de la stationnarité) et approches bioinformatiques (analyse de la balance des flux, incorporation des données génétiques).
