Université Lyon 1
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  • Domaine : Licences du domaine SCIENCES ET TECHNOLOGIES
  • Diplôme : Licence
  • Mention : Informatique
  • Parcours : Bio-informatique
   
    Présentation :
Modalité de formation :
Formation diplômante
Nature de la Formation :
Diplôme national
Niveau de recrutement :
BAC, BAC+1, BAC+2
Niveau de sortie :
BAC+3
Durée de la formation :
6 semestres
Site web pour plus d'information :
http://licence-info.univ-lyon1.fr/
Adresse web d'inscription :
https://ecandidat.univ-lyon1.fr/
Documents à télécharger :
Export PDF des descriptifs de cette formation
Lieux de formation :
Cette formation est dispensée principalement sur le(s) site(s) suivant(s) :
  • Villeurbanne - La Doua
Langues d'enseignement :
  • FR  Français
    Secteurs disciplinaires concernés :
  • Biologie - Biochimie
  • Informatique
  • Sciences de l'ingénieur
    Activités socio-économiques en lien avec la formation :
  • Pharmacie - Cosmétologie
  • Informatique - Information - Communication
Date de la dernière mise-à-jour : 19/12/2022
    Description de la formation :

Il s'agit d'une mention interdisciplinaire dont l'objectif est de former des étudiants:

  1. à établir le dialogue entre les Sciences de la Vie, les Mathématiques et l'Informatique puis à mettre en oeuvre des techniques adaptées.
  2. à analyser et interpréter des données biologiques puis en extraire des informations pertinentes en vue de la compréhension et de la modélisation des processus impliqués.

Cette formation prépare aux métiers de techniciens, ingénieurs ou chercheurs Bio-Mathématiciens, Bio-Statisticiens et/ou Bio-Informaticiens. Ces métiers en pleine expansion répondent à une demande toujours croissante de personnes aux compétences interdisciplinaires.

Le parcours Bio-informatique permet d’acquérir les concepts de bases et les outils méthodologiques pour analyser, interpréter des données biologiques puis en extraire des informations pertinentes en vue de la compréhension et de la modélisation des processus impliqués.

L’objectif de ce parcours est de fournir une double compétence en biologie comme discipline mineure dans la formation. La discipline majeure reste l'informatique. Il existe un parcours symétrique dans la licence science de la Vie, ou la discipline majeure est la biologie : le parcours Bio-informatique, statistique et modélisation.

Pour le parcours bio-info: en L1, les étudiants suivent la licence commune du portail maths-info avec des UE optionnelles en biologie (biologie et modélisation et génétique). En L2 et L3 certaines UE informatique sont remplacées par des UE biologiques. Il ne s'agit pas d'UE d'initiation, mais d'UE mutualisées avec le département bio-sciences.


L’objectif de la licence mention Informatique est de donner les bases nécessaires pour la poursuite d’études prioritairement dans le domaine de l’informatique, avec une orientation vers la bio informatique pur ce parcours. L’étudiant peut aussi décider d’intégrer le monde du travail à l’issue du L3. Afin de renforcer le caractère professionnel de ce diplôme, le programme fait une part importante aux outils de base du développement de logiciels et se conclut par un stage individuel d’une durée de 3 mois dans une entreprise. L'offre de formation comprend six semestres dont les trois premiers forment un socle de base commun aux mentions Mathématiques et Informatique, avec une orientation en semestre 3. Les semestres 5 et 6 sont complètement spécialisés.
    Compétences attestées :
Connaître les principes d'algorithmique afin de pouvoir concevoir un programme pertinent répondant à un problème donné;
 
Connaître les différents paradigmes de programmation : itérative, récursive, procédurale, fonctionnelle, orientée objet;
Savoir mettre en œuvre des algorithmes en utilisant des langages de programmation variés et leurs outils de mise au point associés;
Savoir mettre en œuvre (implantation), évaluer et choisir les différents types de données selon le problème posé;
Savoir analyser un algorithme/programme afin d'en connaitre les coûts mémoire et d'exécution;
Concevoir et réaliser en programmation orientée objet;
Lire ou exprimer des spécifications complexes avec des formalismes abstraits (UML);
Savoir planifier les étapes du développement d'un projet informatique;
Connaître l’architecture matérielle et logicielle des ordinateurs;
Connaître les différents systèmes d’exploitation;
Connaître l'architecture d'Internet, ses principaux protocoles, l'adressage et le routage IP;
Savoir mettre en œuvre un réseau local et le raccorder à Internet;
Connaître les principes et les contraintes de la programmation concurrente;
Utiliser une base de données relationnelle;
Concevoir un schema de base de donnée relationnelle;
Optimiser les performances d'une base de données relationnelle;



    Modalités d'évaluation :
Les modalités d'évaluation sont arrêtées annuellement par le Conseil d'Administration, sur proposition du Conseil des Etudes et de la Vie Universitaire. Pour 2007-2008:
- la compensation au sein des blocs (informatique, transversal, stage et projet en L3) est automatique ;
- la licence est validée par validation individuelle des 3 années ;
    Program Description :
This is an interdisciplinary mention whose objective is to train students
  • to establish a dialogue between Life Sciences, Mathematics and Computer Science and then to implement adapted techniques.
  • to analyze and interpret biological data and extract relevant information for the understanding and modeling of the processes involved.
This training prepares students for jobs as technicians, engineers or researchers in Biomathematics, Biostatistics and/or Bioinformatics. These rapidly expanding professions meet an ever-increasing demand for people with interdisciplinary skills.

The Bioinformatics course provides the basic concepts and methodological tools for analyzing and interpreting biological data and then extracting relevant information for understanding and modeling the processes involved.

The objective of this course is to provide a double competence in biology as a minor discipline in the training. The major discipline remains computer science. There is a symmetrical pathway in the Life Science license, where the major discipline is biology: the Bioinformatics, Statistics and Modeling pathway.

For the bio-info pathway: in L1, students follow the common license of the math-info portal with optional UE in biology (biology and modeling and genetics). In L2 and L3, certain computer science courses are replaced by biological courses. These are not introductory courses, but courses shared with the bio-sciences department.

The objective of the computer science degree is to give the necessary basis for further studies, primarily in the field of computer science, with an orientation towards bio-computing for this course. The student can also decide to enter the world of work at the end of the L3. In order to reinforce the professional character of this diploma, the program focuses on the basic tools of software development and concludes with a 3-month individual internship in a company. The program includes six semesters, the first three of which form a common base for the Mathematics and Computer Science fields, with an orientation in semester 3. Semesters 5 and 6 are completely specialized.
    Potential Students and Prerequisites :
Entry into L1: Hold a French general baccalaureate (mathematics specialization strongly recommended, other scientific specializations in particular NSI also recommended) or from the European Union (for other foreign baccalaureates, there is a special procedure called Demande d'Admission Préliminaire, DAP).

Entry into L2: A student who has started a degree in another institution can present a file to the pedagogical commission which can validate certain UE and propose a personalized course.

Entry into L3: A student who has completed a DUT, a BTS or who comes from a preparatory class for the grandes écoles (CPGE) can submit a file to the pedagogical commission which can validate certain UE and propose a personalized program.

In L2 and L3, the commission will adapt the course to possibly give the missing skills in biology. It is recommended to also apply for the computer science course in case the commission does not accept the bioinformatics application.
    Public concerné :

Entrée en L1 : être titulaire d'un baccalauréat général français (spécialité mathématiques très fortement recommandée, autres spécialités scientifiques en particulier NSI également recommandées) ou de l'union europénne (pour les autres baccalauréats étrangers, il y a une procédure particulière intitulée demande d'admission préalable, DAP).

Entrée en L2 : Un étudiant ayant commencé une licence dans un autre établissement peut présenter un dossier à la commission pédagogique qui peut valider certaines UE et lui proposer un parcours personnalisé.

Entrée en L3 : Un étudiant ayant validé un DUT, un BTS ou venant de classe préparatoire aux grandes écoles (CPGE) peut présenter un dossier à la commission pédagogique qui peut valider certaines UE et lui proposer un parcours personnalisé.

En L2 et L3 la commission adaptera le parcours pour éventuellement donner les compétences en biologie manquantes. Il est recommandé de déposer également une candidature dans le parcours informatique pour le cas où la commission n'accepterai pas la candidature en bio-informatique.


    Potential Students and Prerequisites :
Entry into L1: Hold a French general baccalaureate (mathematics specialization strongly recommended, other scientific specializations in particular NSI also recommended) or from the European Union (for other foreign baccalaureates, there is a special procedure called Demande d'Admission Préliminaire, DAP).

Entry into L2: A student who has started a degree in another institution can present a file to the pedagogical commission which can validate certain UE and propose a personalized course.

Entry into L3: A student who has completed a DUT, a BTS or who comes from a preparatory class for the grandes écoles (CPGE) can submit a file to the pedagogical commission which can validate certain UE and propose a personalized program.

In L2 and L3, the commission will adapt the course to possibly give the missing skills in biology. It is recommended to also apply for the computer science course in case the commission does not accept the bioinformatics application.
    Responsabilité du Parcours :
LADJAL HAMID
 hamid.ladjaluniv-lyon1.fr
04.72.43.16.36
    Contact scolarité :
Licence STS scolarité
 scolarite.licence.stsuniv-lyon1.fr
04.72.43.29.05
    Composante(s) de l'université responsable de cette formation :
Département - Composante d'Informatique
    Liste des Unités d'Enseignement (UE) :
  • Année 1
  • Année 2
  • Année 3
    Statistiques d’insertion professionnelle :
Les enquêtes d’insertion professionnelle sont réalisées par l'Observatoire de la Vie Etudiante : accéder aux statistiques.
    Métiers : (en référence à Vocasciences)
Au vue des connaissances et des compétences acquises durant la formation, des stages réalisés et/ou des concours réussis, les diplômés de cette formation peuvent prétendre aux métiers suivants :
 Administrateur de bases de données 
 Administrateur de logiciel de laboratoire 
 Bio-informaticien 
 Biostatisticien 
 Data-manager 
 Développeur 
 Gestionnaire de bases de données cliniques 
    Répertoire national des certifications professionnelles (RNCP) :
Lien fiche RNCP sur France Compétences