Université Lyon 1
Arqus
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  • Unité d'enseignement : Bases de données pour la bioinformatique
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : INF1151M
    Responsabilité de l'UE :
DUCHATEAU FABIEN
 fabien.duchateauuniv-lyon1.fr
04.72.44.58.25
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
10.5 h
Travaux Dirigés (TD)
7.5 h
Travaux Pratiques (TP)
12 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Pré-requis :
Bases de la programmation en Python (UE POO du M1 Bioinformatique)
    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :
Modélisation et conception de bases de données
Différentes catégories de base de données :
    - modèle relationnel + langage d'interrogation SQL
    - modèle arbre (XML) + langages d'interrogation XPath / Xquery
    - modèle document (JSON) + langage d'interrogation de MongoDB
    - modèle graphe (RDF) + langage d'interrogation SPARQL
Intégration de données
    Programme de l'UE / Thématiques abordées :
L'objectif de l'UE BDBIO est de présenter différents modèles de données (relationnel, arbre, graphe, document) ainsi que les langages d'interrogation qui permettent de manipuler les données stockées. L'UE se termine par un introduction à l'intégration de données, qui consiste à fournir un accès uniforme à des données hétérogènes généralement représentées par des modèles différents. Un mini-projet permet de mettre en pratique ces aspects intégration sur les modèles étudiés.
Date de la dernière mise-à-jour : 20/10/2022
SELECT MEN_ID, `MEN_DIP_ABREVIATION`, `MEN_TITLE`, `PAR_TITLE`, `PAR_ID` FROM parcours INNER JOIN ue_parcours ON PAR_ID_FK=PAR_ID INNER JOIN mention ON MEN_ID = PAR_MENTION_FK WHERE PAR_ACTIVATE = 0 AND UE_ID_FK='19393' ORDER BY `MEN_DIP_ABREVIATION`, `MEN_TITLE`, `PAR_TITLE`