Ateliers d'analyses en génomique environnementale : Fiche UE : Offre de formation

Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BIO2605M

Responsabilité de l'UE :

LEFEBURE TRISTAN

tristan.lefebureuniv-lyon1.fr

04.72.44.79.54

Type d'enseignement

Nb heures *

Cours Magistraux (CM)

2 h

Travaux Dirigés (TD)

18 h

Travaux Pratiques (TP)

30 h

Durée de projet en autonomie (PRJ)

20 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

Pré-requis :

Campagne d'échantillonnage (S1)

Biologie moléculaire pour la génomique environnementale (S2)

Programmation pour la biologie (S2)

Méthodes d'analyse de données génomiques/ transcriptomiques (S2)

Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

Apprentissage de la réalisation d'un mini-projet de recherche complet (de la collecte d'échantillons, aux analyses bioinformatiques et statistiques à la rédaction d'une synthèse des résultats).

Programme de l'UE / Thématiques abordées :

Cette UE organisera l’analyse et la diffusion des données obtenues dans l’UE “Biologie moléculaire pour la génomique environnementale”. L’UE est constituée d’ateliers dont le contenu dépendra des jeux de données produits aux semestres précédents. Les ateliers auront pour objectifs d’organiser l’analyse des jeux de données et seront ponctués d’interventions sur des points méthodologiques (bioinformatiques, statistiques) mais également sur des éléments de communications (archivage, documentation, rapport, présentation orale). Les objectifs attendus de cette UE sont la prise d’autonomie, la mise en place de bonnes pratiques en bioinformatique, le retour vers les questions écologiques et la communication de ces résultats.

Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :

M. mention : Biodiversité, écologie et évolution : M2 Génomique Environnementale