- Unité d'enseignement : Modélisation des réseaux métaboliques
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BIO2674M
Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
9 h
Travaux Pratiques (TP)
21 h
* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.
Pré-requis :
Notions de base de programmation en python et en métabolisme
Compétences attestées (transversales, spécifiques) :
L'enseignement dispensé dans cette UE a pour objectif de :
- sensibiliser des non spécialistes aux problèmes de la modélisation des réseaux métaboliques
- savoir utiliser les principaux concepts et techniques de modélisation.
- s'assurer de la cohérence d'un modèle par rapport à des observations réelles et à en extraire de nouvelles informations.
- d'identifier différents régimes de fonctionnement, les voies optimales et les cibles pour optimiser/empêcher la production de molécules.
- prédir les comportements face à des pertubations.
Programme de l'UE / Thématiques abordées :
1- Introduction à la modélisation des réseaux
2- Modélisation dynamique des réseaux métaboliques
3- Analyse topologique des réseaux : Modes élémentaires de flux, coupures minimales
4- Introduction à la programmation par contrainte
5- Modélisation à base de contraintes des réseaux métaboliques : Flux Balance Analysis (FBA), dynamic FBA, FBA with molecular crowding
Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
Date de la dernière mise-à-jour : 29/08/2024
SELECT MEN_ID, `MEN_DIP_ABREVIATION`, `MEN_TITLE`, `PAR_TITLE`, `PAR_ID` FROM parcours INNER JOIN ue_parcours ON PAR_ID_FK=PAR_ID INNER JOIN mention ON MEN_ID = PAR_MENTION_FK WHERE PAR_ACTIVATE = 0 AND UE_ID_FK='25943' ORDER BY `MEN_DIP_ABREVIATION`, `MEN_TITLE`, `PAR_TITLE`
