Université Lyon 1
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  • Unité d'enseignement : TP Caractérisation structure fonction de l'oncoprotéine Tax
Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BCH1040M
    Responsabilité de l'UE :
POPGEORGIEV NIKOLAY
 nikolay.popgeorgievuniv-lyon1.fr
VIOLOT SEBASTIEN
 sebastien.violotuniv-lyon1.fr
04.37.65.29.04
    Type d'enseignement
Nb heures *
Travaux Dirigés (TD)
3 h
Travaux Pratiques (TP)
55 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Pré-requis :
Suivi de toutes les unités d'enseignement des semestres 1 et 2
Connaissance des concepts fondamentaux de l'ingénierie moléculaire, de l'homéostasie cellulaire, de biologie structurale et de biophysique
    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :
Maîtrise de diverses approches d'ingénierie moléculaire et de techniques de biophysique
    Programme de l'UE / Thématiques abordées :
Cette UE de travaux pratiques permettra l’ensemble des étapes permettant de vérifier la monodispersité d’un échantillon de macromolécule biologique et de résoudre sa structure à l’échelle atomique par CryoEM, cristallographie aux rayons X et RMN sur un exemple concret: l’oncoprotéine Tax du rétrovirus humain HTLV-1. L’étude structurale sera particulièrement poussée et détaillée dans le cadre de ce TP.

Techniques mises en oeuvre: 
  • Biologie structurale et biophysique: Manipulations en pièce humides (DLS, SLS, SAXS, cristallogenèse, préparation de grilles, vitrification), enregistrement des données sur instruments dédiés (diffractomètre rayons X, spectromètre RMN, cryo-microscope) traitement de données sur poste informatique (diffraction X, attribution spectre RMN, classes 2D en cryoEM et interprétation de cartes 3D) .
  • Biologie moléculaire : PCR, mutagenèse, clonage
  • Biochimie des protéines : western-blot
  • Double hybride en système levure
  • Microbiologie moléculaire : culture, transformation et conjugaison de bactéries et de levures

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