Initiation à la bio-informatique structurale : Fiche UE : Offre de formation

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Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BCH3005L
UE Obligatoire pour ce parcours
UE valable pour le semestre 5 de ce parcours

Responsabilité de l'UE :

DELEAGE GILBERT

gilbert.deleageuniv-lyon1.fr

04.72.72.26.55

g.deleageibcp.fr

BETTLER EMMANUEL

emmanuel.bettleruniv-lyon1.fr

04.72.72.26.07

emmanuel.bettleribcp.fr

Type d'enseignement

Nb heures *

Cours Magistraux (CM)

18 h

Travaux Dirigés (TD)

0 h

Travaux Pratiques (TP)

12 h

Total du volume horaire

30 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

Conditions d'accès à l'UE :

Connaissance de la structure des protéines comme enseigné dans l'UE Biomolécules-B

Programme - Contenu de l'UE :

Introduction/Contexte

Banques de données

Séquences (UniProtKB, SWISSPROT)

Signatures

Comparaison de séquences

Alignements de séquences

Profil d'identité

Profiles physico-chimiques

Prédictions de structures secondaires

Utlisation de RasMol

TP N°1 Banques de séquences UniprotKB - Homologies de séquences - Alignements multiples - Identifications de sites fonctionnels
TP N°2 Analyse de séquences - Visualisation et manipulation de structures 3D de protéines.Utilisation de Rasmol.
TP N°3 Evaluation

Compétences acquises :

Méthodologiques :
Compétences en bioanalyse de séquences protéiques et en manipulations de structures 3D de protéines.

Techniques :

Modalités de contrôle des connaissances et Compétences 2021-2022 :

Type	Libellé	Session	Nature	Coef.
CT	CT : lnitiation Bio-Inform structurale	session 1	Ecrit	-
CT	CT : lnitiation Bio-Inform structurale	session 2	Ecrit	-
CT	CT : lnitiation Bio-Inform structurale	session 1	TP/Ecrit (TP sess1 et ECRIT sess2)	-
CT	CT : lnitiation Bio-Inform structurale	session 2	TP/Ecrit (TP sess1 et ECRIT sess2)	-

Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :

Date de la dernière mise-à-jour : 08/02/2022