Les microorganismes se caractérisent par une remarquable capacité d’adaptation à leur environnement. L’enseignement de Microbiologie 2 vise à illustrer la diversité des mécanismes cellulaires et moléculaires développés par les microorganismes pro et eucaryotes en réponse à des changements environnementaux et plus particulièrement dans le cas de stratégies infectieuses.
La mise en place et l’implication de différents éléments structurels (systèmes de sécrétion, mécanisme de mobilité, quorum sensing, synthèse pariétale et croissance…) nécessaires à ces mécanismes sont développés dans le cas des bactéries, champignons filamenteux , levures et protistes. Différents exemples de stratégies infectieuses sont présentés.
Les notions d’holobionte et de microbiote sont abordées. La description et le rôle du microbiote intestinal sont plus particulièrement traités.
Le cours est complété par des Travaux Pratiques et Dirigés qui ont pour objectif la mise en œuvre de techniques d’isolement et d’identification de bactéries (entérobactéries, coques) et de mycètes (champignons filamenteux, levures). Les techniques classiques de la microbiologie (mise en culture, isolement, observations microscopiques, tests biochimiques (galeries Api…))ainsi que des techniques de biologie moléculaire sont mises en œuvre.
