Outils stats et informatiques pour les analyses omiques : Fiche UE : Offre de formation

Unité d'enseignement :

Outils stats et informatiques pour les analyses omiques

Nombre de crédits : 3 ECTS

Code Apogée : IPH2292M

Contient des enseignements proposés en anglais et des documents totalement disponibles en anglais

Responsabilité de l'UE :

BARDEL DANJEAN CLAIRE

claire.bardel-danjeanuniv-lyon1.fr

SAINTIGNY PIERRE

pierre.saintignyuniv-lyon1.fr

Type d'enseignement

Nb heures *

Cours Magistraux (CM)

8 h

Travaux Dirigés (TD)

8 h

Travaux Pratiques (TP)

14 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

* Savoir choisir la méthode statistique appropriée pour le traitement et la visualisation de données massives

* Savoir interpréter les résultats des analyses statistiques

* Savoir manipuler des fichiers avec R et avec les outils de base unix (bash, grep, ...)

Programme de l'UE / Thématiques abordées :

Cette UE à pour but de former les étudiants aux outils biostatistiques et bioinformatique
utiles pour analyser des données massives en cancérologie. Les différentes notions abordées
sont:
* introduction à l'utilisation de linux et à la manipulation de fichiers en ligne de commande
* introduction à R pour la manipulation et la visualisation des données ainsi que pour l'analyse statistique

* bases de statistiques pour l'analyse des données massives (techniques de réduction de la dimension, régressions logistique et linéaire, corrections pour les tests multiples, évaluation des biomarqueurs, méthodes de classification)