Université Lyon 1
Arqus
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  • Unité d'enseignement : Outils stats et informatiques pour les analyses omiques
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : IPH2292M
    Responsabilité de l'UE :
BARDEL DANJEAN CLAIRE
 claire.bardel-danjeanuniv-lyon1.fr
SAINTIGNY PIERRE
 pierre.saintignyuniv-lyon1.fr
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
8 h
Travaux Dirigés (TD)
8 h
Travaux Pratiques (TP)
14 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :
* Savoir choisir la méthode statistique appropriée pour le traitement et la visualisation de données massives
* Savoir interpréter les résultats des analyses statistiques
* Savoir manipuler des fichiers avec R et avec les outils de base unix (bash, grep, ...)
    Programme de l'UE / Thématiques abordées :
Cette UE à pour but de former les étudiants aux outils biostatistiques et bioinformatique
utiles pour analyser des données massives en cancérologie. Les différentes notions abordées
sont:
 * introduction à l'utilisation de linux et à la manipulation de fichiers en ligne de commande
 * introduction à R pour la manipulation et la visualisation des données ainsi que pour l'analyse statistique
 * bases de statistiques pour l'analyse des données massives (techniques de réduction de la dimension, régressions logistique et linéaire, corrections pour les tests multiples, évaluation des biomarqueurs, méthodes de classification)
    Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
SELECT MEN_ID, `MEN_DIP_ABREVIATION`, `MEN_TITLE`, `PAR_TITLE`, `PAR_ID` FROM parcours INNER JOIN ue_parcours ON PAR_ID_FK=PAR_ID INNER JOIN mention ON MEN_ID = PAR_MENTION_FK WHERE PAR_ACTIVATE = 0 AND UE_ID_FK='24780' ORDER BY `MEN_DIP_ABREVIATION`, `MEN_TITLE`, `PAR_TITLE`
ver. 24.03.1