Concepts et méthodologies en écologie microbienne : Fiche UE : Offre de formation

Domaine : Masters du domaine SCIENCES ET TECHNOLOGIES
Diplôme : Master
Mention : Microbiologie
Parcours : M2 Microbiologie moléculaire, pathogénie, écologie microbienne
Unité d'enseignement : Concepts et méthodologies en écologie microbienne

Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BIO2591M
UE Libre pour ce parcours
UE valable pour le semestre 1 de ce parcours

Responsabilité de l'UE :

MOENNE-LOCCOZ YVAN

yvan.moenne-loccozuniv-lyon1.fr

Type d'enseignement

Nb heures *

Cours Magistraux (CM)

21 h

Travaux Dirigés (TD)

0 h

Travaux Pratiques (TP)

0 h

Durée de projet en autonomie (PRJ)

0 h

Durée du stage

0 h

Effectif Cours magistraux (CM)

210 étudiants

Effectif Travaux dirigés (TD)

35 étudiants

Effectif Travaux pratiques (TP)

18 étudiants

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

Pré-requis :

Connaissances avancées en microbiologie et écologie microbienne

Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

Développement et intégration de savoirs hautement spécialisés (RNCP34151BC02)

- Mobiliser des savoirs hautement spécialisés, dont certains sont à l’avant-garde du savoir dans un domaine de travail ou d’études, comme base d’une pensée originale

- Développer une conscience critique des savoirs dans un domaine et/ou à l’interface de plusieurs domaines

- Conduire une analyse réflexive et distanciée prenant en compte les enjeux, les problématiques et la complexité d’une demande ou d’une situation afin de proposer des solutions adaptées

Programme de l'UE / Thématiques abordées :

L’UE traite de concepts majeurs et de méthodologies en microbiologie et en écologie microbienne, et notamment de leurs utilisations dans le cadre des démarches de recherche scientifique. Après des rappels d’écologie microbienne, nous aborderons la notion d’écosystème microbien et conséquences pratiques, la notion de populations microbiennes et l'utilité des concepts associés (aspects taxonomiques, niche écologique, migrations et métapopulations), la signification des éléments génétiques mobiles et génomique évolutive microbienne, la diversité microbienne (définitions, évaluations, significations), les interactionshôte-microorganismes ainsi que les outils moléculaires d’analyse de ces interactions, la relation entre populations microbiennes et fonctionnement des écosystèmes/hôtes. Nous terminerons avec les concepts de microbiomes et métagénomique.

Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :

[mention : Microbiologie] M2 Microbiologie moléculaire, pathogénie, écologie microbienne