Université Lyon 1
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  • Unité d'enseignement : Modélisation probabiliste en bio-informatique
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BIO1342M
    Responsabilité de l'UE :
GUEGUEN LAURENT
 laurent.gueguenuniv-lyon1.fr
04.72.44.62.98
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
10 h
Travaux Dirigés (TD)
0 h
Travaux Pratiques (TP)
20 h
Durée de projet en autonomie (PRJ)
0 h
Durée du stage
0 h
Effectif Cours magistraux (CM)
210 étudiants
Effectif Travaux dirigés (TD)
35 étudiants
Effectif Travaux pratiques (TP)
18 étudiants

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :
Concepts et outils usuels de modélisation probabiliste, qui sont au coeur de nombreux outils
de bioinformatique
    Programme de l'UE / Thématiques abordées :
En bioinformatique, la manipulation et l’analyse de données nécessitent très souvent des méthodes à même de gérer la complexité et la variabilité des données, ainsi que le bruit présent dans ces données (dû aussi bien à la stochasticité des processus biologiques à l’origine de ces données, qu’aux techniques d’acquisition). Ces méthodes font essentiellement appel à la modélisation probabiliste. Il est nécessaire que les étudiants, à la fois pour comprendre les méthodes existantes que pour ensuite en concevoir de nouvelles, connaissent les ressorts d’une telle modélisation, à la fois conceptuels et techniques. Ainsi, nous étudierons les concepts fondamentaux de la modélisation probabiliste (vraisemblance, maximum de vraisemblance, démarche bayésienne, décodage a posteriori), ainsi que des modèles usuels (chaînes de Markov),  dans le contexte de leur utilisation en bioinformatique.
Date de la dernière mise-à-jour : 15/11/2021
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