Université Lyon 1
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  • Unité d'enseignement : Biologie de synthèse
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BCH2033M
    Responsabilité de l'UE :
RICARD-BLUM SYLVIE
 sylvie.ricard-blumuniv-lyon1.fr
04.72.44.82.32
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
22.5 h
Travaux Dirigés (TD)
1.5 h
Travaux Pratiques (TP)
0 h
Durée de projet en autonomie (PRJ)
0 h
Durée du stage
0 h
Effectif Cours magistraux (CM)
210 étudiants
Effectif Travaux dirigés (TD)
35 étudiants
Effectif Travaux pratiques (TP)
18 étudiants

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :
Utiliser les savoirs et concepts de la biochimie pour la mise au point et l'utilisation d'applications à visées médicales, technologiques ou industrielles
Utiliser les concepts fondamentaux de la biochimie microbienne et leurs applications en biologie de synthèse
    Programme de l'UE / Thématiques abordées :

L'objectid de cette UE ets de présenter les différents aspects de la biologie de synthèse, les outils informatiques et biologiques nécessaires respectivement à la conception et la construction de dispositifs biologiques synthétiques, les différentes étapes de leur construction puis leurs applications dans le domaine de la santé, de l'agro-alimentaire, de l'environnement et de l'énergie.


Thèmes abordés


- Définition et buts

- Biosûreté, biosécurité, double usage de la recherche, enjeux sociétaux

- Les biobriques : définition,  construction, méthodes d’assemblage

- Les châssis : bactéries, levures

- Les outils : choix des éléments, surcharge de l’hôte), vitesse d’initiation de la traduction d’une séquence, force des promoteurs, riborégulateurs, TIGRs, scaffolds, microcompatimentation, réactions enzymatiques couplées et flux métaboliques, 

- Exemples de systèmes synthétiques  synthèse d’anti-paludéen,, microbes thérapeutiques

- Génômes artificiels, évolution chimique des génômes, la xénobiologie

- Les répressilateurs 

- Aspects prédictifs à la biologie de synthèse : problématiques (allocation des ressources, équilibres homéostatiques…), modélisation métabolique (reconstruction du métabolisme à l’échelle du génome, principe de la stationnarité) et approches bioinformatiques (analyse de la balance des flux, incorporation des données génétiques).



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