Université Lyon 1
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  • Unité d'enseignement : Protein design
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BCH2039M
    Responsabilité de l'UE :
AGUERO-PIZZOLO STEPHANIE
 stephanie.aguero-pizzolouniv-lyon1.fr
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
7.5 h
Travaux Dirigés (TD)
1.5 h
Travaux Pratiques (TP)
9 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Pré-requis :
    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

competences spécifiques :

Se former aux bases du Protein Design. 

Connaitre les principales approches de conception. 

Savoir définir un objectif de conception en réponse à une problématique concrète. 

Apprendre à mettre en œuvre une stratégie de conception rationnelle (de la phase in silico en passant par la production et la validation expérimentale des modèles proposés).

Compétences trasnversales :
Résoudre des problèmes pour développer de nouveaux savoirs et de nouvelles procédures et intégrer les savoirs de différents domaines
Conduire un projet
    Programme de l'UE / Thématiques abordées :

Thèmes abordés : Conception rationnelle de protéines, Evolution dirigée, Interactions protéines-protéines.

Techniques mises en œuvre : Conception computationnelle de protéine (CPD), mutagénèse dirigée, tests d’affinité et de liaison


L’UE se composera de :

  • 7,5h de cours portant sur l’histoire du Protein Design, les différentes stratégies existantes ainsi que les réalisations les plus marquantes de ce domaine. Le cours inclura également une partie portant sur les méthodes informatiques et expérimentales mobilisées.
  • 1,5h de TD au cours desquels les étudiants prépareront le TP (bibliographie sur le sujet, définition de l’objectif de conception et proposition de stratégie)
  • 9h de TP réparties en deux temps : 4h de CPD « Computational protein design » suivi de 5h de validation expérimentale des modèles générés.
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ver. 24.03.1