Université Lyon 1
Arqus
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  • Unité d'enseignement : Introduction à la biologie des systèmes
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BCH1011M
    Responsabilité de l'UE :
RICARD-BLUM SYLVIE
 sylvie.ricard-blumuniv-lyon1.fr
04.72.44.82.32
    Contact scolarité :
BENKADOUR CHRYSTELL
 chrystell.benkadouruniv-lyon1.fr
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
18 h
Travaux Dirigés (TD)
9 h
Travaux Pratiques (TP)
0 h
Durée de projet en autonomie (PRJ)
0 h
Durée du stage
0 h
Effectif Cours magistraux (CM)
210 étudiants
Effectif Travaux dirigés (TD)
35 étudiants
Effectif Travaux pratiques (TP)
18 étudiants

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

- Appréhender, de manière intégrée, les propriétés fonctionnelles et structurales des macromolécules biologiques (réseaux d’interactions, systèmes complexes, omiques)

    Programme de l'UE / Thématiques abordées :

Etude des systèmes complexes :

- Approches intégratives et multi-omiques (transcriptomiques, protéomiques, interactomiques)
- Construction d’interactomes (réseaux d’interactions)
- Méthodes d’étude des interactions haut débit (TAP-MS, Protein Complementation Assay...)
- Prédictions des interactions (in silico)
- Bases de données d’interactions, curation, vocabulaire contrôlé, ontologies
- Contextualisation des réseaux d’interactions (intégration de données)
- Analyses bioinformatiques de données -omiques : Gene Ontology, pathways (Reactome) et analyses d’enrichissement
- Analyses topologique, structurale et fonctionnelle des réseaux d’interactions
- Apport de la métabolomique à la biologie des systèmes (Principes analytiques et cross-validation, utilisation des bases de données, approches statistiques et bioinformatiques, intégration aux autres données omiques

Date de la dernière mise-à-jour : 06/05/2020
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