Ateliers d'analyses en génomique environnementale : Fiche UE : Offre de formation

Domaine : Masters du domaine SCIENCES ET TECHNOLOGIES
Diplôme : Master
Mention : Biodiversité, écologie et évolution
Parcours : M2 Génomique Environnementale
Unité d'enseignement : Ateliers d'analyses en génomique environnementale

Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BIO2605M
UE Libre pour ce parcours
UE valable pour le semestre 1 de ce parcours

Responsabilité de l'UE :

LEFEBURE TRISTAN

tristan.lefebureuniv-lyon1.fr

04.72.44.79.54

Type d'enseignement

Nb heures *

Cours Magistraux (CM)

2 h

Travaux Dirigés (TD)

18 h

Travaux Pratiques (TP)

30 h

Durée de projet en autonomie (PRJ)

20 h

Durée du stage

0 h

Effectif Cours magistraux (CM)

210 étudiants

Effectif Travaux dirigés (TD)

35 étudiants

Effectif Travaux pratiques (TP)

18 étudiants

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

Pré-requis :

Campagne d'échantillonnage (S1)

Biologie moléculaire pour la génomique environnementale (S2)

Programmation pour la biologie (S2)

Méthodes d'analyse de données génomiques/ transcriptomiques (S2)

Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

Apprentissage de la réalisation d'un mini-projet de recherche complet (de la collecte d'échantillons, aux analyses bioinformatiques et statistiques à la rédaction d'une synthèse des résultats).

Programme de l'UE / Thématiques abordées :

Cette UE organisera l’analyse et la diffusion des données obtenues dans l’UE “Biologie moléculaire pour la génomique environnementale”. L’UE est constituée d’ateliers dont le contenu dépendra des jeux de données produits aux semestres précédents. Les ateliers auront pour objectifs d’organiser l’analyse des jeux de données et seront ponctués d’interventions sur des points méthodologiques (bioinformatiques, statistiques) mais également sur des éléments de communications (archivage, documentation, rapport, présentation orale). Les objectifs attendus de cette UE sont la prise d’autonomie, la mise en place de bonnes pratiques en bioinformatique, le retour vers les questions écologiques et la communication de ces résultats.

Liste des autres Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :

[mention : Biodiversité, écologie et évolution] M2 Génomique Environnementale