Université Lyon 1
Université de Lyon
Arqus
  • Domaine : Masters du domaine SCIENCES, TECHNOLOGIES, SANTE
  • Diplôme : Master
  • Mention : Biologie moléculaire et cellulaire
  • Parcours : M2 Biologie Tissulaire et imagerie : morphogénèse et réparation (BioTiss)
  • Unité d'enseignement : Imagerie fonctionnelle
Nombre de crédits de l'UE : 3
Code APOGEE : BIO1165M
UE Libre pour ce parcours
UE valable pour le semestre 1 de ce parcours
    Responsabilité de l'UE :
GRANGEASSE CAROLINE
 caroline.grangeasse2univ-lyon1.fr
04.72.72.26.59
    Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
0 h
Travaux Dirigés (TD)
3 h
Travaux Pratiques (TP)
22.5 h
Durée de projet en autonomie de l'étudiant (PRJ)
0 h
Durée du stage
0 h
Effectifs Cours magistraux (CM)
210 étudiants
Travaux dirigés (TD)
35 étudiants
Travaux pratiques (TP)
18 étudiants

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

    Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

- Utiliser les technologies de microscopie (photonique et électronique).

- Conduire un mini-projet de recherche fondamentale dans le domaine de la biologie cellulaire et de la bio-imagerie

- Réaliser des protocoles expérimentaux dans le domaine de la biologie cellulaire et mettant en œuvre les technologies de la microscopie.

- Maitriser différentes techniques et méthodologies employées en biologie cellulaire et bio-imagerie.

- Se servir des outils numériques pour le traitement et l’analyse d’images.

- Analyser et synthétiser des données en vue de leur exploitation.

- Développer une argumentation avec esprit critique.

- Résoudre des problèmes pour développer de nouveaux savoirs et de nouvelles procédures et intégrer les savoirs de différents domaines.

- Identifier, sélectionner et analyser avec esprit critique diverses ressources spécialisées pour documenter un sujet et synthétiser ces données en vue de leur exploitation.

- Communiquer à des fins de formation ou de transfert de connaissances, par oral et par écrit


    Programme de l'UE / Thématiques abordées :

L’objectif de cette UE est de présenter les nombreuses possibilités d’analyse offertes aux chercheurs par les techniques modernes de microscopie photonique et électronique. Afin de découvrir et pratiquer certaines techniques de microscopie, différentes thématiques biologiques sont abordées : la phagocytose, la forme et la migration des cellules ou encore le développement musculaire. Les expériences sont conduites sur des cellules en culture et sur le poisson zèbre, un organisme modèle vertébré. Lors des TP, les étudiants préparent les échantillons, acquièrent les images sur différents microscopes, traitent/analysent ces images et interprètent les résultats. Les thèmes abordés lors de ces TP permettent d’appréhender des notions essentielles de l’imagerie en biologie : la résolution, les marquages multiples, la co-localisation, la reconstruction tri-dimensionnelle à l’échelle de la cellule et de l’organisme. L’analyse et la mise en forme des résultats permettent aux étudiants de se familiariser avec les concepts de base du traitement et de l’analyse d’image.

Techniques mises en œuvre :

Microinjection d’embryons, transgenèse transitoire, immunomarquages fluorescents.

Microscopie photonique, Biréfringence, Microscopie à épifluorescence, microscopie confocale à balayage LASER, microscopie électronique à balayage, vidéo-microscopie. Cette UE bénéficie de l’accès à des systèmes de microscopies de pointe, situés sur les plateformes du Lymic : le CTµ à la Doua, le CIQLE à Rockfeller et le PLATIM à Gerland. Elle permet donc de visiter ces structures, de rencontrer le personnel et d’utiliser ces appareillages.

Date de la dernière mise-à-jour : 19/04/2018
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