* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.
Méthodologiques
Recherche bibliographique - Communication scientifique à l’oral - Analyse et interprétation de données expérimentales - Mobilisation des concepts fondamentaux et des technologies de biologie moléculaire, de biochimie, de biologie cellulaire, de génétique, de microbiologie, et de physiologie, pour traiter une question biologique - Démarche expérimentale - Travail en équipe autant qu’en autonomie et responsabilité au service d’un projet - Dévelopement d'une argumentation avec esprit critique
Spécifiques: Culture et manipulation de nématodes - Inactivation de gènes par interférence à l'ARN chez le nématode - Analyse de phénotypes mutants chez le nématode (macroscopique : animaux entiers, microscopique : marquage de tissus) - Cartographie génétique par PCR à l'aide de marqueurs moléculaires (RFLP/snip-snp) - Analyse de l'expression d'un gène rapporteur chez des nématodes transgéniques -Mise en application de l’approche CRISPRS/Cas9- Techniques de biochimie, de biologie moléculaire et cellulaire- Interrogation de banques de données, analyse de séquences
L’objectif des TP est d’initier l’étudiant aux approches de génétique fonctionnelle chez l’organisme modèle invertébré Caenorhabditis elegans. L’étudiant-e réalisera des expériences de génétique classique, de génétique moléculaire et de biologie cellulaire, analysera des résultats expérimentaux et développera un raisonnement scientifique pour proposer des stratégies et expériences permettant de répondre à une question biologique donnée.
Les manipulations permettront à l’étudiant de s’initier aux méthodes modernes de la génétique fonctionnelle. Les TP sont organisés sous forme d’un projet de recherche tel qu’il peut se présenter dans un laboratoire.
A partir d’une souche de nématodes C. elegans obtenue après mutagenèse aléatoire et présentant un phénotype d’intérêt, le gène muté sera identifié. Différentes approches seront combinées pour étudier et caractériser le gène ainsi identifié : analyse du profile d’expression et de la localisation sub-cellulaire de la protéine correspondante, analyse des interactions génétiques, recherche de partenaires moléculaires de la protéine correspondante.