Objectifs pédagogiques :
Permettre aux étudiants de maîtriser les trois principales méthodes expérimentales de détermination de structures de macromolécules biologiques à l’échelle atomique : la cristallographie aux rayons X, la résonance magnétique nucléaire et la cryo-microscopie électronique à transmission. Application à l’étude des relations structure/fonction.
Thèmes abordés
- Cristallographie aux rayons X : cristallogenèse, vitrification des cristaux, générateur de rayons X, enregistrement et traitement des données de diffraction, techniques de phasage (MR, MIR, MAD, SAD) et calcul de cartes de densité électronique, construction, affinement et analyse de structures cristallines
- RMN : Bases théoriques et techniques, spécificités de la détermination structurale en solution, enregistrement de spectres RMN, spectres 2D et 3D, dynamique, attribution et détermination structurale. Etudes des interactions protéine-ligand, criblage par RMN, docking et drug-design couplé à la RMN, Metabolomics.
- CryoEM : préparation de grilles, vitrification, cryo-microscope, principes de formation d’image, projections, reconstruction 3D à partir d’images 2D, estimation de la résolution, interprétation de cartes cryo-EM, construction et affinement de modèles atomiques
