Biologie structurale : Fiche UE : Offre de formation

Nombre de crédits : 6 ECTS

Code Apogée : BCH1005M

Responsabilité de l'UE :

GOUET PATRICE

patrice.gouetuniv-lyon1.fr

04.72.72.26.24

patrice.gouetibcp.fr

Contact scolarité :

Scolarité BIOSCIENCES

scolarite.biosciencesuniv-lyon1.fr

Type d'enseignement

Nb heures *

Cours Magistraux (CM)

36 h

Travaux Dirigés (TD)

9 h

* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.

Pré-requis :

Connaissances de niveau licence en microscopie optique, spectroscopie et sur bases structurales des macromolécules biologiques ainsi qu’en mathématiques pour les sciences du vivant

Compétences attestées (transversales, spécifiques) :

À l’issue de cette UE, les étudiants/

maîtriseront l’essentiel des processus expérimentaux permettant d’observer des structures de macromolécules biologiques à haute résolution (RMN, cristallographie aux rayons X, cryo-microscopie électronique).
auront une meilleure compréhension des données structurales disponibles dans la Protein Data Bank (https://www.rscb.org).
appréhenderont, de manière intégrée, les propriétés fonctionnelles et structurales des macromolécules biologiques.
sauront résoudre des problèmes de biologie structurale pour développer de nouveaux savoirs et de nouvelles procédures en biochimie.
pourront conduire une analyse réflexive et distanciée, prenant en compte les enjeux et les problématiques d’une demande en biochimie structurale afin de proposer des solutions adaptées et/ou innovantes.

Programme de l'UE / Thématiques abordées :

- Cristallographie aux rayons X : cristallogenèse, vitrification, générateur de rayons X et source de rayonnement synchrotron, enregistrement et traitement des données de diffraction X, techniques de phasage, calcul de cartes de densité électronique, construction, affinement et analyse de structures cristallines

- RMN : Bases théoriques et techniques, spécificités de la détermination structurale en solution, sensibilité mouvements des macromolécules, détection de liaisons à des ligands, enregistrement de spectres RMN, spectres 2D, couplage scalaire, dipolaire, attribution et géométrie.

- Cryo-EM : préparation d’échantillon en coloration négative et en congelé-hydraté, fonctionnement d’un cryomicroscope, principes de formation d’image, projections, reconstruction 3D à partir d’images 2D, analyse de particules isolées, tomographie électronique, estimation de la résolution, interprétation de cartes cryo-EM, construction et affinement de modèles atomiques.

Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :

Date de la dernière mise-à-jour : 10/10/2025