- Unité d'enseignement : TP Caractérisation structure fonction de l'oncoprotéine Tax
Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BCH1040M
Type d'enseignement
Nb heures *
Travaux Pratiques (TP)
55 h
* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.
Pré-requis :
Suivi de toutes les unités d'enseignement des semestres 1 et 2
Connaissance des concepts fondamentaux de l'ingénierie moléculaire, de l'homéostasie cellulaire, de biologie structurale et de biophysique
Compétences attestées (transversales, spécifiques) :
Maîtrise de diverses approches d'ingénierie moléculaire et de techniques de biophysique
Programme de l'UE / Thématiques abordées :
Cette UE de travaux pratiques permettra l’ensemble des étapes permettant de vérifier la monodispersité d’un échantillon de macromolécule biologique et de résoudre sa structure à l’échelle atomique par CryoEM, cristallographie aux rayons X et RMN sur un exemple concret: l’oncoprotéine Tax du rétrovirus humain HTLV-1. L’étude structurale sera particulièrement poussée et détaillée dans le cadre de ce TP.
Techniques mises en oeuvre:
- Biologie structurale et biophysique: Manipulations en pièce humides (DLS, SLS, SAXS, cristallogenèse, préparation de grilles, vitrification), enregistrement des données sur instruments dédiés (diffractomètre rayons X, spectromètre RMN, cryo-microscope) traitement de données sur poste informatique (diffraction X, attribution spectre RMN, classes 2D en cryoEM et interprétation de cartes 3D) .
- Biologie moléculaire : PCR, mutagenèse, clonage
- Biochimie des protéines : western-blot
- Double hybride en système levure
- Microbiologie moléculaire : culture, transformation et conjugaison de bactéries et de levures
Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
SELECT MEN_ID, `MEN_DIP_ABREVIATION`, `MEN_TITLE`, `PAR_TITLE`, `PAR_ID` FROM parcours INNER JOIN ue_parcours ON PAR_ID_FK=PAR_ID INNER JOIN mention ON MEN_ID = PAR_MENTION_FK WHERE PAR_ACTIVATE = 0 AND UE_ID_FK='26099' ORDER BY `MEN_DIP_ABREVIATION`, `MEN_TITLE`, `PAR_TITLE`