Les développements technologiques de ces dernières décennies ont bouleversé l’acquisition de données en biologie. La complexité des jeux de données produits, leur taille, et leur diversité demandent une compréhension de base des techniques qui sous tendent leur production pour mieux les appréhender et les utiliser.
Cette UE a pour but d’initier les étudiant.e.s à quelques avancées technologiques au travers de TP longs, l’objectif étant d’apporter un début d’autonomie avant l’entrée en stage de M1 et M2. Quatre thématiques de TP sont proposées:
- Séquençage haut-débit et analyse métabarcoding pour décrire la diversité de communautés naturelles
- Utilisation des isotopes stables en abondance naturelle et avec marquage pour étudier les préférences trophiques des organismes
- PCR quantitative pour quantifier la présence d’organismes, de gènes de fonction ou d’expression de gènes
- Système d’information géographique pour la description de paysages
Les TP favorisent un approche où l’étudiant.e est acteur de l’acquisition des données, depuis le plan expérimental, l’échantillonnage, les préparations en laboratoire, l’utilisation de machines dédiées, l’analyse des sorties brutes et leur contrôle qualité. Les étudiant.e.s suivront 3 TP sur les 4 ci-dessus.
