- Unité d'enseignement : Microbiologie des écosystèmes naturels et anthropisés
Nombre de crédits de l'UE : 6
Code APOGEE : BIO1412M
Type d'enseignement
Nb heures *
Cours Magistraux (CM)
21 h
Travaux Pratiques (TP)
39 h
* Ces horaires sont donnés à titre indicatif.
Pré-requis :
Connaissance de base en écologie microbienne et microbiologie
Compétences attestées (transversales, spécifiques) :
Etre capable de construire et mettre en peuvre une démarche scientifique; comprendre le rôle des microorganismes, de la diversité taxinomique et fonctionnelle des communautés microbiennes dans le fonctionnement des écosystèmes
Programme de l'UE / Thématiques abordées :
L’objectif de l’UE est l’acquisition des concepts théoriques et des méthodologies à l’interface de la microbiologie, de l’écologie, et de l’éco-toxicologie permettant de comprendre le rôle primordial des microorganismes dans le fonctionnement et la dynamique des écosystèmes naturels ou anthropisés, et de manière symétrique, d’évaluer les conséquences écologiques des perturbations du milieu sur les communautés microbiennes et sur les fonctions dont elles sont responsables.
Le rôle de la diversité taxinomique et fonctionnelle des communautés microbiennes dans le fonctionnement des écosystèmes naturels sera illustré au travers d’exemples dans des écosystèmes terrestres et aquatiques par rôle des microorganismes dans les transformations de différents composés et les conséquences sur les écosystèmes.
Les conséquences écologiques de perturbations d’origine anthropique (pollution, changement globaux) à l’échelle des communautés microbiennes seront présentés, ainsi que l’utilisation des microorganismes et de leurs capacités de dégradation, notamment des xénobiotiques, dans la protection des écosystèmes et la réhabilitation de sites contaminés par les activités industrielles. Les activités microbiennes impliquées dans ces activités de dépollution seront détaillées.
Les travaux pratiques permettront de construire et mettre en œuvre une démarche scientifique en réponse à une problématique, d’illustrer les concepts de résistance et de résilience, d’analyser la biodiversité et les conséquences de perturbation à l’échelle des communautés microbiennes.
Parcours / Spécialité / Filière / Option utilisant cette UE :
- M. mention : Biodiversité, écologie et évolution : M1 Biodiversité, écologie et évolution
- M. mention : Biodiversité, écologie et évolution : M2 Bioévaluation des écosystèmes et expertise de la biodiversité
- M. mention : Biodiversité, écologie et évolution : M2 Ecologie de l’Anthropocène : urbanisation, biodiversité, eau
- M. mention : Biodiversité, écologie et évolution : M2 Ecologie, évolution, génomique
- M. mention : Biodiversité, écologie et évolution : M2 Génomique Environnementale
- M. mention : Biodiversité, écologie et évolution : M2 Integrated Watershed Sciences - H2O’Lyon
- M. mention : Biologie végétale : M2 Plant Microbe Interactions for Plant Health
- M. mention : Microbiologie : M1 Microbiologie
- M. mention : Microbiologie : M2 Microbiologie appliquée à l'agroalimentaire, au biomédical et à l'environnement
- M. mention : Microbiologie : M2 Microbiologie moléculaire, pathogénie, écologie microbienne
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